Atypische C-ANCA erzeugen auf Ethanol-fixierten Granulozyten eine feingranuläre, im Vergleich zu C-ANCA gleichmäßigere zytoplasmatische Fluoreszenz, auf Formalin-fixierten Zellen reagieren die Antikörper nicht.
Antikörper gegen Proteinase-3 zeigen auf den Ethanol-fixierten Schnitten eine gröber granuläre zytoplasmatische Fluoreszenz mit Akzentuierung zwischen den Kernlappen. Auf Formalin-fixierten Granulozyten erzeugen diese eine grob granuläre zytoplasmatische Fluoreszenz.
Antikörper gegen Ribosomen (ribP) zeigen auf Ethanol-fixierten Zellen eine ähnliche Fluoreszenz, färben auch das Zytoplasma von Formalin-fixierten Granulozyten und von HEp-2 Zellen.
Die klinische oder diagnostische Bedeutung von atypischen C-ANCA ist weitgehend unbekannt.
Atypische C-ANCA werden beim Screening auf ANCA mit der Immunfluoreszenz erkannt, spezifische Immunoassays stehen nicht zur Verfügung